Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Meis3P97368 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Meis3P97368 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Meis3P97368 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Meis3P97368 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Meis3P97368 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Meis3P97368 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms