Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkp1P97350 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pkp1P97350 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkp1P97350 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms