Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CiitaP79621 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CiitaP79621 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CiitaP79621 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CiitaP79621 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CiitaP79621 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CiitaP79621 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CiitaP79621 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CiitaP79621 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CiitaP79621 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CiitaP79621 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms