Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
Abcc9P70170 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC44.55■■■■■ 4.72
Abcc9P70170 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
Abcc9P70170 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
Abcc9P70170 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
Abcc9P70170 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC44.54■■■■■ 4.72
Abcc9P70170 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Abcc9P70170 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
Abcc9P70170 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Abcc9P70170 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
Abcc9P70170 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC44.52■■■■■ 4.72
Abcc9P70170 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
Abcc9P70170 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
Abcc9P70170 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
Abcc9P70170 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Abcc9P70170 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Abcc9P70170 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Abcc9P70170 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Abcc9P70170 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Abcc9P70170 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
Abcc9P70170 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
Abcc9P70170 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
Abcc9P70170 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Abcc9P70170 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Abcc9P70170 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
Abcc9P70170 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
Abcc9P70170 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
Abcc9P70170 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC44.45■■■■■ 4.71
Abcc9P70170 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Abcc9P70170 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Abcc9P70170 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC44.45■■■■■ 4.71
Abcc9P70170 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Abcc9P70170 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC44.44■■■■■ 4.7
Abcc9P70170 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Abcc9P70170 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Abcc9P70170 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC44.43■■■■■ 4.7
Abcc9P70170 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC44.43■■■■■ 4.7
Abcc9P70170 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
Abcc9P70170 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
Abcc9P70170 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
Abcc9P70170 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
Abcc9P70170 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
Abcc9P70170 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
Abcc9P70170 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
Abcc9P70170 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
Abcc9P70170 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
Abcc9P70170 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Abcc9P70170 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Abcc9P70170 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
Abcc9P70170 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
Abcc9P70170 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC44.38■■■■■ 4.69
Abcc9P70170 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
Abcc9P70170 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Abcc9P70170 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Abcc9P70170 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC44.36■■■■■ 4.69
Abcc9P70170 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
Abcc9P70170 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
Abcc9P70170 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Abcc9P70170 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Abcc9P70170 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC44.34■■■■■ 4.69
Abcc9P70170 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Abcc9P70170 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Abcc9P70170 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
Abcc9P70170 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.69
Abcc9P70170 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC44.32■■■■■ 4.69
Abcc9P70170 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC44.32■■■■■ 4.69
Abcc9P70170 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Abcc9P70170 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Abcc9P70170 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.69
Abcc9P70170 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC44.29■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC44.28■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC44.27■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC44.26■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Abcc9P70170 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms