Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtf2bP62915 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms