Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snap25P60879 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snap25P60879 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snap25P60879 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snap25P60879 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snap25P60879 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Snap25P60879 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snap25P60879 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snap25P60879 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snap25P60879 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snap25P60879 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snap25P60879 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snap25P60879 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snap25P60879 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms