Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rp1P56716 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rp1P56716 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rp1P56716 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rp1P56716 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rp1P56716 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rp1P56716 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rp1P56716 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rp1P56716 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rp1P56716 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rp1P56716 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rp1P56716 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rp1P56716 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rp1P56716 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rp1P56716 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rp1P56716 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rp1P56716 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms