Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp5bP56480 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp5bP56480 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp5bP56480 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.4 ms