Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp5P56399 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp5P56399 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp5P56399 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp5P56399 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp5P56399 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp5P56399 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp5P56399 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp5P56399 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp5P56399 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp5P56399 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp5P56399 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp5P56399 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp5P56399 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp5P56399 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp5P56399 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms