Protein–RNA interactions for Protein: P56391

Cox6b1, Cytochrome c oxidase subunit 6B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6b1P56391 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox6b1P56391 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox6b1P56391 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms