Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrp1P56183 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rrp1P56183 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms