Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc12a1P55014 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms