Protein–RNA interactions for Protein: P54775

Psmc4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc4P54775 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmc4P54775 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmc4P54775 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psmc4P54775 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms