Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PctpP53808 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PctpP53808 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PctpP53808 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PctpP53808 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PctpP53808 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PctpP53808 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PctpP53808 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PctpP53808 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PctpP53808 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PctpP53808 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PctpP53808 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PctpP53808 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PctpP53808 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PctpP53808 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PctpP53808 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PctpP53808 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PctpP53808 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PctpP53808 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PctpP53808 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PctpP53808 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PctpP53808 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PctpP53808 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PctpP53808 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PctpP53808 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PctpP53808 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PctpP53808 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PctpP53808 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PctpP53808 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PctpP53808 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PctpP53808 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PctpP53808 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PctpP53808 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PctpP53808 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PctpP53808 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PctpP53808 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PctpP53808 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PctpP53808 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PctpP53808 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PctpP53808 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PctpP53808 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PctpP53808 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PctpP53808 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PctpP53808 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PctpP53808 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PctpP53808 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PctpP53808 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PctpP53808 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PctpP53808 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PctpP53808 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PctpP53808 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PctpP53808 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PctpP53808 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PctpP53808 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PctpP53808 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PctpP53808 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PctpP53808 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PctpP53808 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PctpP53808 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PctpP53808 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PctpP53808 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PctpP53808 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PctpP53808 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PctpP53808 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PctpP53808 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PctpP53808 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PctpP53808 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PctpP53808 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PctpP53808 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PctpP53808 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PctpP53808 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PctpP53808 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PctpP53808 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PctpP53808 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PctpP53808 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PctpP53808 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PctpP53808 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PctpP53808 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PctpP53808 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PctpP53808 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PctpP53808 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PctpP53808 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PctpP53808 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PctpP53808 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PctpP53808 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PctpP53808 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PctpP53808 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PctpP53808 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PctpP53808 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PctpP53808 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PctpP53808 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PctpP53808 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PctpP53808 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PctpP53808 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PctpP53808 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PctpP53808 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PctpP53808 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PctpP53808 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PctpP53808 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PctpP53808 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms