Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dbx1P52950 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Dbx1P52950 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dbx1P52950 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms