Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MipP51180 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MipP51180 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MipP51180 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MipP51180 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MipP51180 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MipP51180 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MipP51180 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MipP51180 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MipP51180 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MipP51180 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MipP51180 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MipP51180 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MipP51180 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MipP51180 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MipP51180 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MipP51180 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MipP51180 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MipP51180 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MipP51180 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MipP51180 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MipP51180 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MipP51180 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MipP51180 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MipP51180 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MipP51180 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MipP51180 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MipP51180 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MipP51180 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MipP51180 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MipP51180 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MipP51180 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MipP51180 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MipP51180 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MipP51180 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MipP51180 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MipP51180 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MipP51180 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MipP51180 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MipP51180 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MipP51180 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MipP51180 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MipP51180 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MipP51180 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MipP51180 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MipP51180 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MipP51180 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MipP51180 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MipP51180 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MipP51180 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MipP51180 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MipP51180 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MipP51180 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MipP51180 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MipP51180 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MipP51180 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MipP51180 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MipP51180 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MipP51180 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MipP51180 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MipP51180 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MipP51180 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MipP51180 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MipP51180 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MipP51180 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MipP51180 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MipP51180 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MipP51180 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MipP51180 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MipP51180 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MipP51180 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MipP51180 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MipP51180 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MipP51180 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MipP51180 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MipP51180 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MipP51180 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MipP51180 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MipP51180 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MipP51180 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MipP51180 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MipP51180 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MipP51180 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MipP51180 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MipP51180 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MipP51180 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MipP51180 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MipP51180 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MipP51180 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MipP51180 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MipP51180 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MipP51180 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MipP51180 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MipP51180 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MipP51180 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MipP51180 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MipP51180 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MipP51180 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MipP51180 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MipP51180 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms