Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt6aP50446 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt6aP50446 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms