Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psen1P49769 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psen1P49769 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psen1P49769 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psen1P49769 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psen1P49769 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Psen1P49769 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psen1P49769 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms