Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ercc3P49135 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ercc3P49135 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms