Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epb41P48193 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epb41P48193 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epb41P48193 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epb41P48193 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epb41P48193 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epb41P48193 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epb41P48193 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Epb41P48193 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Epb41P48193 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epb41P48193 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epb41P48193 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epb41P48193 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms