Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkn1bP46414 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms