Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upk2P38575 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upk2P38575 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upk2P38575 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk2P38575 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms