Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab20P35295 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab20P35295 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab20P35295 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab20P35295 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab20P35295 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab20P35295 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab20P35295 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab20P35295 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab20P35295 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms