Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SsbP32067 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SsbP32067 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SsbP32067 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SsbP32067 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SsbP32067 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SsbP32067 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SsbP32067 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SsbP32067 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SsbP32067 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SsbP32067 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SsbP32067 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SsbP32067 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SsbP32067 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SsbP32067 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SsbP32067 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SsbP32067 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SsbP32067 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SsbP32067 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SsbP32067 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SsbP32067 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SsbP32067 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SsbP32067 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SsbP32067 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SsbP32067 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SsbP32067 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SsbP32067 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SsbP32067 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SsbP32067 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SsbP32067 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SsbP32067 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SsbP32067 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SsbP32067 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SsbP32067 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SsbP32067 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SsbP32067 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SsbP32067 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SsbP32067 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SsbP32067 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SsbP32067 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SsbP32067 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SsbP32067 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SsbP32067 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SsbP32067 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SsbP32067 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SsbP32067 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SsbP32067 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SsbP32067 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SsbP32067 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SsbP32067 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SsbP32067 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SsbP32067 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SsbP32067 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SsbP32067 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SsbP32067 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SsbP32067 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SsbP32067 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SsbP32067 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SsbP32067 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SsbP32067 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SsbP32067 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SsbP32067 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SsbP32067 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SsbP32067 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SsbP32067 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SsbP32067 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SsbP32067 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SsbP32067 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SsbP32067 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SsbP32067 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SsbP32067 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SsbP32067 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SsbP32067 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SsbP32067 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SsbP32067 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SsbP32067 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SsbP32067 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SsbP32067 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SsbP32067 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SsbP32067 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SsbP32067 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SsbP32067 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SsbP32067 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SsbP32067 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SsbP32067 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SsbP32067 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SsbP32067 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SsbP32067 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SsbP32067 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SsbP32067 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SsbP32067 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SsbP32067 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SsbP32067 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SsbP32067 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SsbP32067 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SsbP32067 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SsbP32067 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SsbP32067 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SsbP32067 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SsbP32067 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms