Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc11P31313 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc11P31313 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms