Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kif3aP28741 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms