Protein–RNA interactions for Protein: P28575

Ipp, Actin-binding protein IPP, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IppP28575 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IppP28575 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IppP28575 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IppP28575 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IppP28575 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IppP28575 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IppP28575 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IppP28575 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IppP28575 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IppP28575 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IppP28575 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IppP28575 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IppP28575 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IppP28575 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IppP28575 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IppP28575 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IppP28575 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IppP28575 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IppP28575 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IppP28575 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IppP28575 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IppP28575 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IppP28575 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IppP28575 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IppP28575 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IppP28575 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IppP28575 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IppP28575 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IppP28575 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
IppP28575 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IppP28575 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IppP28575 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IppP28575 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IppP28575 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IppP28575 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IppP28575 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IppP28575 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IppP28575 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IppP28575 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IppP28575 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IppP28575 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IppP28575 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IppP28575 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IppP28575 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IppP28575 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IppP28575 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IppP28575 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IppP28575 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IppP28575 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IppP28575 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IppP28575 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IppP28575 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IppP28575 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IppP28575 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IppP28575 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IppP28575 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IppP28575 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IppP28575 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IppP28575 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IppP28575 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IppP28575 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IppP28575 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IppP28575 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IppP28575 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IppP28575 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IppP28575 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IppP28575 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IppP28575 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IppP28575 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IppP28575 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IppP28575 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IppP28575 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IppP28575 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IppP28575 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IppP28575 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IppP28575 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IppP28575 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IppP28575 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IppP28575 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IppP28575 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IppP28575 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IppP28575 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IppP28575 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IppP28575 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IppP28575 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IppP28575 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IppP28575 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IppP28575 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IppP28575 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IppP28575 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IppP28575 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IppP28575 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IppP28575 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IppP28575 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IppP28575 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IppP28575 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IppP28575 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IppP28575 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IppP28575 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IppP28575 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms