Protein–RNA interactions for Protein: P27681

Gabrg3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg3P27681 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabrg3P27681 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabrg3P27681 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabrg3P27681 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabrg3P27681 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabrg3P27681 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabrg3P27681 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabrg3P27681 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabrg3P27681 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabrg3P27681 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabrg3P27681 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabrg3P27681 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabrg3P27681 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabrg3P27681 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabrg3P27681 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabrg3P27681 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabrg3P27681 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabrg3P27681 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms