Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afxP27661 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afxP27661 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afxP27661 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afxP27661 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afxP27661 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afxP27661 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2afxP27661 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afxP27661 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afxP27661 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afxP27661 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afxP27661 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afxP27661 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms