Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnna1P26231 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna1P26231 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctnna1P26231 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnna1P26231 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms