Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmo2P25801 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmo2P25801 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms