Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gria1P23818 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gria1P23818 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gria1P23818 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gria1P23818 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gria1P23818 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gria1P23818 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gria1P23818 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gria1P23818 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gria1P23818 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gria1P23818 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gria1P23818 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gria1P23818 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gria1P23818 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms