Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxd12P23812 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd12P23812 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd12P23812 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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