Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm3P21107 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tpm3P21107 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms