Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prim1P20664 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prim1P20664 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prim1P20664 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prim1P20664 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prim1P20664 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Prim1P20664 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prim1P20664 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prim1P20664 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Prim1P20664 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prim1P20664 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prim1P20664 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prim1P20664 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prim1P20664 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prim1P20664 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prim1P20664 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prim1P20664 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prim1P20664 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prim1P20664 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prim1P20664 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prim1P20664 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prim1P20664 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prim1P20664 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prim1P20664 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prim1P20664 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prim1P20664 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms