Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fcer1aP20489 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fcer1aP20489 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms