Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NelfeP19426 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NelfeP19426 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NelfeP19426 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NelfeP19426 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NelfeP19426 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NelfeP19426 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NelfeP19426 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NelfeP19426 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NelfeP19426 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NelfeP19426 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NelfeP19426 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NelfeP19426 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NelfeP19426 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NelfeP19426 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NelfeP19426 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NelfeP19426 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NelfeP19426 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NelfeP19426 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NelfeP19426 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NelfeP19426 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NelfeP19426 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NelfeP19426 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms