Protein–RNA interactions for Protein: P17532

Tph1, Tryptophan 5-hydroxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph1P17532 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tph1P17532 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tph1P17532 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tph1P17532 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tph1P17532 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tph1P17532 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tph1P17532 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tph1P17532 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tph1P17532 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms