Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RhoP15409 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RhoP15409 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RhoP15409 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RhoP15409 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RhoP15409 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RhoP15409 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RhoP15409 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RhoP15409 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RhoP15409 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RhoP15409 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RhoP15409 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RhoP15409 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RhoP15409 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RhoP15409 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RhoP15409 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RhoP15409 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RhoP15409 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RhoP15409 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RhoP15409 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RhoP15409 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RhoP15409 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RhoP15409 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RhoP15409 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RhoP15409 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RhoP15409 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RhoP15409 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RhoP15409 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RhoP15409 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RhoP15409 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RhoP15409 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RhoP15409 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RhoP15409 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RhoP15409 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RhoP15409 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RhoP15409 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RhoP15409 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RhoP15409 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RhoP15409 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RhoP15409 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RhoP15409 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RhoP15409 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RhoP15409 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RhoP15409 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RhoP15409 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RhoP15409 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RhoP15409 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RhoP15409 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RhoP15409 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RhoP15409 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RhoP15409 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RhoP15409 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RhoP15409 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RhoP15409 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RhoP15409 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RhoP15409 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RhoP15409 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RhoP15409 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RhoP15409 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RhoP15409 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RhoP15409 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RhoP15409 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RhoP15409 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RhoP15409 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RhoP15409 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RhoP15409 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RhoP15409 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RhoP15409 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RhoP15409 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RhoP15409 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RhoP15409 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RhoP15409 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RhoP15409 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RhoP15409 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RhoP15409 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RhoP15409 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RhoP15409 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RhoP15409 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RhoP15409 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RhoP15409 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RhoP15409 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RhoP15409 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RhoP15409 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RhoP15409 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RhoP15409 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RhoP15409 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RhoP15409 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RhoP15409 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RhoP15409 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RhoP15409 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RhoP15409 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RhoP15409 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RhoP15409 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RhoP15409 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RhoP15409 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RhoP15409 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RhoP15409 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RhoP15409 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RhoP15409 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RhoP15409 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms