Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd5P13379 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd5P13379 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd5P13379 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd5P13379 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd5P13379 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd5P13379 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd5P13379 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd5P13379 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd5P13379 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd5P13379 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd5P13379 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd5P13379 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd5P13379 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd5P13379 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd5P13379 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd5P13379 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd5P13379 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms