Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 360.7 ms