Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FlgP11088 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FlgP11088 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FlgP11088 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FlgP11088 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FlgP11088 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FlgP11088 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FlgP11088 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FlgP11088 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FlgP11088 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FlgP11088 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FlgP11088 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FlgP11088 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FlgP11088 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FlgP11088 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FlgP11088 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FlgP11088 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FlgP11088 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FlgP11088 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FlgP11088 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FlgP11088 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FlgP11088 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FlgP11088 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FlgP11088 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FlgP11088 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FlgP11088 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FlgP11088 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FlgP11088 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FlgP11088 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FlgP11088 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FlgP11088 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FlgP11088 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FlgP11088 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FlgP11088 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FlgP11088 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FlgP11088 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FlgP11088 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FlgP11088 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FlgP11088 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FlgP11088 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FlgP11088 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FlgP11088 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FlgP11088 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FlgP11088 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FlgP11088 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FlgP11088 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FlgP11088 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FlgP11088 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FlgP11088 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FlgP11088 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FlgP11088 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FlgP11088 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FlgP11088 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FlgP11088 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FlgP11088 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FlgP11088 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FlgP11088 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FlgP11088 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FlgP11088 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FlgP11088 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FlgP11088 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FlgP11088 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FlgP11088 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FlgP11088 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FlgP11088 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FlgP11088 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FlgP11088 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FlgP11088 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FlgP11088 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FlgP11088 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FlgP11088 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FlgP11088 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FlgP11088 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FlgP11088 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FlgP11088 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FlgP11088 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FlgP11088 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FlgP11088 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FlgP11088 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FlgP11088 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FlgP11088 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FlgP11088 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FlgP11088 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FlgP11088 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FlgP11088 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FlgP11088 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FlgP11088 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FlgP11088 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FlgP11088 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FlgP11088 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FlgP11088 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FlgP11088 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FlgP11088 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FlgP11088 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FlgP11088 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FlgP11088 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FlgP11088 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FlgP11088 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FlgP11088 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FlgP11088 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms