Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Schip1P0DPB4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Schip1P0DPB4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms