Protein–RNA interactions for Protein: P0C242

Ccno, Cyclin-O, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnoP0C242 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CcnoP0C242 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CcnoP0C242 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CcnoP0C242 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CcnoP0C242 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CcnoP0C242 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CcnoP0C242 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CcnoP0C242 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CcnoP0C242 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CcnoP0C242 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CcnoP0C242 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CcnoP0C242 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CcnoP0C242 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CcnoP0C242 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CcnoP0C242 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CcnoP0C242 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CcnoP0C242 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CcnoP0C242 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CcnoP0C242 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CcnoP0C242 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcnoP0C242 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CcnoP0C242 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms