Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
P04213 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P04213 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P04213 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
P04213 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P04213 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
P04213 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
P04213 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P04213 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P04213 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P04213 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P04213 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
P04213 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P04213 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P04213 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P04213 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
P04213 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P04213 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P04213 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P04213 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P04213 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P04213 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
P04213 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P04213 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P04213 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P04213 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P04213 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P04213 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P04213 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P04213 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P04213 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P04213 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P04213 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P04213 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P04213 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P04213 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P04213 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P04213 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P04213 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P04213 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P04213 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P04213 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P04213 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P04213 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P04213 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P04213 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
P04213 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P04213 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P04213 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P04213 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P04213 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P04213 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P04213 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P04213 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04213 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04213 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04213 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04213 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04213 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04213 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04213 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P04213 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P04213 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P04213 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P04213 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P04213 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P04213 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P04213 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P04213 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P04213 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P04213 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P04213 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P04213 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P04213 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P04213 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P04213 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P04213 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
P04213 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P04213 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P04213 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P04213 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P04213 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P04213 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P04213 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P04213 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
P04213 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
P04213 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P04213 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P04213 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P04213 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P04213 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
P04213 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P04213 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P04213 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P04213 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P04213 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
P04213 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P04213 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P04213 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P04213 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms