Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01798 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01798 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01798 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01798 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01798 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01798 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01798 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01798 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
P01798 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01798 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01798 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01798 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01798 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01798 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01798 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01798 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01798 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01798 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01798 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01798 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01798 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01798 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01798 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01798 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01798 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01798 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01798 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01798 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01798 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01798 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01798 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01798 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01798 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01798 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01798 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01798 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01798 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01798 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01798 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01798 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01798 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01798 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01798 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01798 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01798 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01798 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01798 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01798 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01798 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01798 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01798 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01798 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01798 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01798 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01798 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01798 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01798 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01798 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01798 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01798 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01798 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01798 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01798 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01798 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01798 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01798 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01798 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01798 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01798 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01798 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01798 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01798 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01798 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01798 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01798 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01798 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01798 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01798 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01798 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01798 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01798 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01798 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01798 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01798 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01798 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01798 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01798 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01798 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01798 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01798 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01798 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01798 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01798 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01798 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01798 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01798 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01798 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01798 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01798 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms