Protein–RNA interactions for Protein: O89051

Itm2b, Integral membrane protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2bO89051 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itm2bO89051 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.8 ms