Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp2O88623 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp2O88623 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp2O88623 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp2O88623 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp2O88623 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp2O88623 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp2O88623 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp2O88623 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp2O88623 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp2O88623 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Usp2O88623 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp2O88623 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp2O88623 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp2O88623 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp2O88623 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp2O88623 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp2O88623 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp2O88623 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp2O88623 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp2O88623 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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