Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srpk1O70551 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk1O70551 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms