Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vamp4O70480 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vamp4O70480 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vamp4O70480 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vamp4O70480 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vamp4O70480 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Vamp4O70480 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Vamp4O70480 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vamp4O70480 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vamp4O70480 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vamp4O70480 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Vamp4O70480 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Vamp4O70480 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Vamp4O70480 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vamp4O70480 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vamp4O70480 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Vamp4O70480 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms